Qhov sib txawv tseem ceeb ntawm MLVA thiab MLST yog tias MLVA siv cov polymorphism ntawm tandemly rov DNA ua ntu zus los ua tus yam ntxwv ntawm cov kab mob microbial, thaum MLST siv cov polymorphism ntawm DNA sib lawv liag ntawm sab hauv ntawm ntau lub tsev tu noob rau cov kab mob microbial.
Kev ntaus kab mob microbial feem ntau yog siv los txiav txim qhov chaw thiab txoj hauv kev kis kab mob. Nws lees paub lossis tswj kev tawm tsam. Microbial typing kuj taug qab kev sib kis ntawm kev noj qab haus huv nrog cov kab mob thiab paub txog cov kab mob phem. Ntxiv mus, microbial typing ntsuas qhov ua tau zoo ntawm kev tswj xyuas cov kab mob pathogenic microbial. MLVA thiab MLST yog ob txoj kev siv tshuaj lom neeg molecular siv hauv microbial typing.
MLVA yog dab tsi?
Multiple loci VNTR tsom xam (MLVA) yog ib txoj hauv kev lom neeg molecular uas siv cov polymorphism ntawm tandemly rov DNA ua ntu zus los ua tus yam ntxwv ntawm cov kab mob microbial. Nws yog ib txoj hauv kev siv rau kev txheeb xyuas caj ces ntawm cov kab mob microbial.
Thaum thawj kauj ruam ntawm MLVA, txhua qhov chaw VNTR lub hom phiaj tau nthuav dav los ntawm PCR nrog flanking thaj av tshwj xeeb primers. Tom qab ntawd cov khoom tawg tau loj yog sib cais los ntawm electrophoresis ntawm lub capillary sequencer. Lub genotyping ntawm txhua qhov chaw thiab cov txiaj ntsig tau muab tso ua ke los ntawm txhua tus qauv tso cai rau tus yam ntxwv ntawm cov kab mob uas nws hom paub. Nws kuj tso cai rau txheeb xyuas cov subspecies los ntawm kev ntaus ntawv allele thiab sib piv rau MLVA databases.
Figure 01: MLVA
Txoj kev MLVA no xaiv ntau dua li MLST txoj kev. Tsis tas li ntawd, MLVA txoj kev tsis tas yuav muaj DNA sequencing kauj ruam. Yog li, nws ua rau nws ua tau kom sib txawv ze subspecies los yog clonal hom.
MLST yog dab tsi?
Multilocus sequence typing (MLST) yog ib qho txheej txheem uas siv cov polymorphism ntawm DNA sib lawv liag ntawm sab hauv ntawm ntau lub tsev tu noob rau cov kab mob microbial. MLST yog cov txheej txheem hauv kev tshuaj ntsuam caj ces rau kev ntaus ntawv ntawm ntau loci.
Daim duab 02: MLST
Nws yog ib hom kev sib sau ua ke siv los ua cov txheej txheem siv los paub qhov txawv ntawm cov kab mob microbial. Txoj kev no yog ua los ntawm kev tu vaj tse noob sequencing. Cov noob hauv tsev feem ntau encode cov protein tseem ceeb ntawm cov kab mob microbial xws li cov kab mob. Cov kab ke ntawm cov noob tu vaj tsev no muaj qhov tshwj xeeb ntawm kev nthuav tawm cov polymorphism ruaj khov nyob rau lub sijhawm. Yog li ntawd, qhov sib txawv hauv cov kab ke ntawm cov noob tu vaj tsev yog txaus txaus kom paub qhov txawv ntawm ib leeg. Tsis tas li ntawd, thawj lub tswv yim MLST yuav tsim yog Neisseria meningitidis, tus kab mob ua rau mob meningococcal meningitis thiab septicemia. Txij li thaum nws tau qhia, MLST tau siv tsis yog rau tib neeg cov kab mob xwb tab sis kuj rau cov kab mob cog.
Qhov Zoo sib xws ntawm MLVA thiab MLST yog dab tsi?
- MLVA thiab MLST yog ob txoj kev siv tshuaj lom neeg molecular siv hauv microbial typing.
- Ob txoj kev siv tau rau kev tshuaj xyuas microbial phylogenetic.
- Ob txoj kev yog ua raws cov caj ces polymorphism.
- Lawv tuaj yeem siv rau kev tshawb nrhiav tib neeg cov kab mob ua rau cov kab mob microbial.
- Ob txoj kev yuav tsum tau ua los ntawm cov kws paub txog molecular biologists.
Qhov txawv ntawm MLVA thiab MLST yog dab tsi?
MLVA yog cov txheej txheem uas siv cov polymorphism ntawm tandemly rov DNA ua ntu zus los ua tus yam ntxwv ntawm cov kab mob microbial. Lub caij no, MLST yog cov txheej txheem uas siv cov polymorphism ntawm DNA sib lawv liag ntawm sab hauv ntawm ntau lub tsev tu noob rau cov kab mob microbial. Yog li, qhov no yog qhov sib txawv tseem ceeb ntawm MLVA thiab MLST. Tsis tas li ntawd, MLVA txoj kev xaiv ntau dua li MLST txoj kev.
Cov hauv qab no infographic nthuav tawm qhov sib txawv ntawm MLVA thiab MLST hauv daim ntawv teev npe rau kev sib piv ntawm ib sab.
Summary – MLVA vs MLST
MLVA thiab MLST yog ob txoj kev siv tshuaj lom neeg molecular siv hauv microbial typing. MLVA siv cov polymorphism ntawm tandemly rov DNA sequences rau characterize microbial hom, thaum MLST siv cov polymorphism ntawm DNA sequences ntawm sab hauv fragments ntawm ntau lub tsev tu noob rau characterize microbial hom. Yog li, qhov no yog qhov txawv ntawm MLVA thiab MLST.
