Qhov Tseem Ceeb Qhov txawv - Nick txhais lus vs Primer Extension
Nick translation thiab primer extension yog ob txoj kev tseem ceeb hauv Molecular biology. Qhov sib txawv tseem ceeb ntawm nick txhais lus thiab primer txuas ntxiv yog cov txheej txheem kev txhais lus nick tsim cov ntawv sau npe rau lwm cov txheej txheem hybridization thaum primer extension txoj kev txheeb xyuas qhov tshwj xeeb RNA ib ntu los ntawm kev sib xyaw thiab nthuav tawm cov ntaub ntawv hais txog kev qhia ntawm mRNA. Ob lub tswv yim muaj qhov tseem ceeb heev thiab niaj hnub ua hauv cov chaw tshawb fawb molecular.
Nick Translation yog dab tsi?
Nick txhais lus yog ib qho tseem ceeb uas siv los npaj cov ntawv sojntsuam rau ntau yam kev siv tshuaj lom neeg xws li blotting, hauv situ hybridization, fluorescent hauv situ hybridization thiab lwm yam. Nws yog ib txoj hauv kev hauv vitro ntawm DNA labelling. DNA sojntsuam yog siv los txheeb xyuas cov DNA lossis RNA ib ntus. Nrog kev pab los ntawm ib daim ntawv lo soj ntsuam, cov khoom tawg yooj yim tuaj yeem raug cim lossis pom los ntawm kev sib xyaw ntawm nucleic acid. Yog li ntawd, daim ntawv lo soj ntsuam tau npaj siv ntau yam kev siv los siv rau ntau hom kev kawm. Nick translation yog ib txoj hauv kev uas tsim cov ntawv soj ntsuam nrog kev pab ntawm DNase 1 thiab DNA polymerase 1 enzymes.
Cov txheej txheem txhais lus nick pib nrog DNase 1 enzyme kev ua haujlwm. DNase 1 qhia nicks nyob rau hauv phosphate qaum qaum ntawm ob stranded DNA los ntawm cleaving phosphodiester bonds ntawm nucleotides. Thaum lub nick yog tsim dawb 3 'OH pawg ntawm nucleotide yuav tau yielded thiab DNA polymerase 1 enzyme yuav ua rau nws. 5' mus rau 3' exonuclease kev ua ntawm DNA polymerase 1 tshem tawm nucleotides los ntawm nick mus rau 3' kev taw qhia ntawm DNA strand. Tib lub sijhawm, cov haujlwm polymerase ntawm DNA polymerase 1 enzyme ua haujlwm thiab ntxiv nucleotides los hloov cov nucleotides tshem tawm. Yog tias cov nucleotides tau sau npe, qhov hloov pauv yuav tshwm sim los ntawm cov ntawv sau npe nucleotides thiab nws yuav cim DNA rau kev txheeb xyuas. Cov ntawv sau tshiab DNA no tuaj yeem siv los ua kev sojntsuam hauv ntau yam kev sib xyaw ua ke hauv Molecular Biology.
Daim duab 01: Nick translation process
Primer Extension yog dab tsi?
Primer txuas ntxiv yog cov txheej txheem uas siv los nrhiav qhov tshwj xeeb RNA ib ntus los ntawm RNA sib xyaw thiab nrhiav qhov 5' kawg ntawm mRNA cov ntawv sau tseg. Nws kuj yog siv los kawm cov qauv ntawm RNA thiab kev qhia. Txoj kev txuas ntxiv primer yog ua nrog cov ntawv sau npe lossis nrog cov ntawv sau npe nucleotides. Yog tias siv cov tshuaj primers, nws tsis suav nrog qhov xav tau ntawm kev sau npe cov nucleotides uas siv rau kev sib txuas ntawm cDNA. Muaj ob peb kauj ruam hauv cov txheej txheem no. Nws pib nrog rho tawm RNA los ntawm cov qauv. Tom qab ntawd ib daim ntawv sau npe oligonucleotide primer ntxiv rau qhov sib xyaw ua ke nrog cov khoom xyaw tsim nyog los ua ke cDNA ntawm ib qho RNA ib ntus. Primer anneals nrog qhov sib ntxiv ua ntu zus los ntawm qhov sib tov. Siv cov primer annealed sequence raws li tus qauv, lub enzyme reverse transcriptase synthesizes lub complementary DNA (cDNA) ntawm RNA ib theem zuj zus. Primer annealing thiab thim rov qab transcription tshwm sim tsuas yog thaum cov RNA ib ntus muaj nyob hauv cov qauv. Thaum kawg, thaum denaturing gel electrophoresis ua tiav, qhov loj ntawm RNA sib lawv liag tuaj yeem txiav txim siab. Nws tseem yog ib qho yooj yim mus nrhiav +1 lub hauv paus ntawm mRNA (transcription pib qhov chaw) ib theem zuj zus los ntawm primer extension txoj kev. Tus nqi ntawm mRNA tam sim no hauv cov qauv tuaj yeem suav tau los ntawm txoj kev no yog tias siv cov primer ntau dhau.
Daim duab 02: Primer txuas ntxiv
Qhov txawv ntawm Nick Txhais thiab Primer Extension yog dab tsi?
Nick Translation vs Primer Extension |
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| Nick txhais lus yog txheej txheem uas tsim cov ntawv sau DNA soj ntsuam rau ntau yam kev sib xyaw ua ke. | Primer txuas ntxiv yog cov txheej txheem siv los nrhiav cov RNA tshwj xeeb lossis los kawm txog cov noob caj noob ces. |
| Enzymes siv | |
| DNase 1 thiab DNA polymerase enzymes tau siv. | Reverse transcriptase enzyme yog siv. |
| Ib qho tseem ceeb | |
| Nick txhais lus pab txhawb qhov cim ntawm DNA ib ntus. | Primer txuas ntxiv ua kom pom qhov tshwj xeeb mRNA ib ntu me me thiab tus nqi tam sim no hauv tus qauv. |
Summary – Nick Translation vs Primer Extension
Nick txhais lus yog ib txoj hauv kev siv los tsim cov ntawv sojntsuam raws li cov haujlwm ntawm DNase 1 thiab E coli DNA polymerase 1 enzymes. Nws yog ib txoj hauv kev hauv vitro ua haujlwm hauv chav kuaj ua ntej cov txheej txheem hybridization sib txawv. Thaum lub sijhawm txhais lus nick, 5'-3' exonuclease kev ua ntawm DNA polymerase 1 tshem tawm nucleotides ua ntej ntawm nick thiab polymerase kev ua ntawm DNA polymerase 1 hloov cov nucleotides tshem tawm nrog cov ntawv sau npe nucleotides tom qab nick. Primer txuas ntxiv yog ib txoj hauv kev uas siv los txheeb xyuas cov ntaub ntawv RNA tshwj xeeb los ntawm kev sib xyaw thiab ntsuas qhov loj thiab tus nqi ntawm cov paj RNA. Qhov no yog qhov txawv ntawm nick txhais lus thiab primer extension.
